vimで置換処理． AをBにしたいとき． :%s/A/B/g vimを少しずつ覚えていきたい．

手元のfastaファイルをまずはアミノ酸に翻訳． 使うのはTransDecoder. Home · TransDecoder/TransDecoder Wiki · GitHub だいたい読めばわかる． 2ステップで，手元ファイルを変換する． TransDecoder.LongOrfs -t hoge.fa TransDecoder.Predict -t hoge.fa …

ID処理でよく使う． perl -pe 's/^(共通接頭辞\.\d+)\.\d+/$1/' ^は1カラムめのときだけ．

テキストファイルをゴニョゴニョしているときに， ^M が入っていて困ったことがあったので，備忘録として． vimにて :%s/検索文字列/置換文字列/g を改変して， :%s/^M//g ただし，^Mは制御コードなので， cntl+vを押して^を入力し，cntl+M と入力する．最初…

vimのメモ帳 指定した文字列を含む行を削除するには :g/消したい文字列/d でOK． 逆に，指定した文字列を含まない行を削除するには， :v/残したい文字列/d で．

homebrew でscienceのbioinfoソフト関連が上手く行かなくなった． brew tap brewsci/science で解決．

ログをみるとgccだが何かがおかしいらしい． ということで， export CXX=g++-4.9 としてから make して終了． 昔，gccをいじったことがいけなかったのかなー．